O Manifesto de Transporte de Resíduos (MTR) é um documento numerado que serve para controlar a expedição, o transporte e o recebimento dos resíduos na unidade de destinação final.
Em alguns estados, o MTR é emitido por meio do Sistema MTR ONLINE através do site da FEPAM e cabe ao gerador proceder com a emissão do mesmo, além disso, uma via impressa do MTR deverá obrigatoriamente acompanhar o transporte dos resíduos sólidos, cabendo ao transportador apresentar o documento MTR aos agentes de fiscalização sempre que solicitado e o destinador deve proceder com a baixa do MTR recebido, bem como emitir o Certificado de Destinação Final (CDF) dos resíduos recebidos.
Para a emissão de um MTR através do Sagi é necessário que todos os envolvidos tenham seus cadastros realizados no sistema.